En ese contexto, el CEU a través de sus Universidades e Institutos de Investigación tiene el objetivo de promover y apoyar la actividad investigadora en el ámbito universitario y empresarial, así como la difusión de los resultados alcanzados en el entorno social. Este objetivo se encuadra también dentro de la apuesta de la institución por la investigación y la internacionalización.
Algunas de las actividades que se desarrollan a través de los Vicerrectorados de Investigación son: la coordinación de los programas de doctorado, la convocatoria de becas pre y postdoctorales, las ayudas a la movilidad investigadora, la gestión de evaluación de sexenios por la CNEAI y las ayudas internas a proyectos de investigación, entre otras.